Исследователи рака демонстрируют интегрированное использование секвенирования следующего поколения и цифровой ПЦР с капельной системой в мониторинге рака на PMWC 2020.
21-24 января 2020 года во время семинара Bio-Rad на Всемирной конференции по точной медицине (PMWC) в Санта-Клара, Калифорния, США, учеными представлены данные, показывающие, как технология Bio-Rad Droplet Digital PCR (ddPCR) может быть использована для эффективного последовательного мониторинга у онкологических больных.
В исследовании подчеркивается, что технология ddPCR может служить мощным дополнением к генетическому профилированию опухолей с помощью секвенирования следующего поколения (NGS), что позволяет эффективно и своевременно выявлять минимальные остаточные заболевания и рецидивы молекул.
Посредством подхода, называемого жидкой биопсией, технология ddPCR количественно определяет генетический материал опухолевых клеток, который был удален и попал в кровоток. Концентрация этой циркулирующей опухолевой ДНК (ктДНК) коррелирует с бременем опухоли более конкретно, чем другие биомаркеры крови, и поэтому ее использование в простом анализе крови может более надежно выявить наличие остаточных или повторяющихся опухолей. С помощью ddPCR можно обнаружить одну мутацию, связанную с раком, из более чем 1000 — или даже 10000 — копий дикого типа со сроками обработки в несколько дней. Получив эти данные, специалисты получают ценную информацию о том, когда добавлять новые или прекращать существующие неработающие методы лечения. Из-за чувствительности теста эта действенная информация собирается задолго до появления клинических симптомов, а результаты достигаются быстро, легко и доступно.
Последовательный мониторинг с использованием технологии ddPCR позволяет врачам выявлять признаки остаточного заболевания и рецидивов в кратчайшие возможные сроки, поэтому своевременные решения о лечении могут быть приняты для улучшения результатов лечения пациента.
Во время сессии обсудили, как технология ddPCR интегрируется с NGS для обеспечения точного последовательного мониторинга после диагностики с использованием нескольких типов генетических биомаркеров рака, включая полиморфизмы однонуклеотидных соединений (SNP) и слияния генов. Был представлен новый метод мониторинга ктДНК с использованием технологии ddPCR без синтетических зондов, что открывает дверь для еще более быстрых и недорогих анализов.
