Научные исследования показали, что система капельной цифровой ПЦР QX200 от Bio-Rad позволяет обнаружить SARS-CoV-2 (вирус, вызывающий COVID-19) с превосходной чувствительностью и точностью по сравнению с иными существующими методами анализа.

Анализы, проводимые в Ухане, Китай,  методом ddPCR показали положительный результат у группы инфицированных людей, у которых тест на COVID-19 по итогам альтернативных исследований был отрицательным. Полученные данные свидетельствуют о том, что ddPCR максимально снижает ложноотрицательные результаты COVID-19 без какого-либо увеличения до ложноположительных результатов и может стать мощным дополнением к текущему стандарту тестирования.

Второе исследование, проведенное Национальным институтом метрологии и региональных Центров по контролю заболеваний в Китае, также пришло к выводу, что ddPCR значительно повышает точность диагностики SARS-CoV-2 с 28,2% до 87,4%, тем самым уменьшая количество ложноотрицательных результатов. Кроме того, они обнаружили, что ddPCR более чувствительна и подходит для образцов с низкой вирусной нагрузкой пациентов, находящихся в изоляции и под наблюдением, даже без каких-либо клинических симптомов.  (https://www.businesswire.com/news/home/20200319005825/en/New-Studies-Find-Bio-Rad%E2%80%99s-QX200-Droplet-Digital)

Принцип работы системы капельной цифровой ПЦР QX200.

Система цифровой ПЦР QX200 сочетает технологию использования капель на основе водно-масляной эмульсии с применением микрофлюидов. Система включает в себя два прибора — генератор капель (QX200) и ридер, а также соответствующие расходные материалы.

Генератор капель разделяет каждый образец на 20 000 однородных капель нанолитрового объема, при этом происходит случайное распределение образца ДНК по каплям. Образовавшаяся эмульсия переносится в 96-луночный планшет для проведения ПЦР. ПЦР по конечной точке проводится в термоциклере. После ее окончания плашка переносится в ридер, где поток капель проходит через этап определения интенсивности флуоресцентного сигнала в каждой капле. Положительные капли, содержащие как минимум одну копию ДНК- или РНК-мишени, показывают повышенную флуоресценцию по сравнению с отрицательными каплями. Фракция ПЦР-положительных капель позволяет проводить количественную оценку мишени согласно распределению Пуассона.

Система цифровой капельной ПЦР QX200 хорошо сочетается с линейными разрушаемыми пробами и интеркалирующим красителем EvaGreen для детектирования флуоресценции. Кроме того, гибкий дизайн системы обеспечивает сочетание высокой производительности с ультрачувствительностью.

QX200 обеспечивает абсолютную количественную оценку целевой ДНК или РНК-молекул без использования калибровочных кривых.

Отмечены следующие преимущества системы QX200:

Более высокая точность и чувствительность по сравнению с количественной ПЦР;

Универсальность системы за счет возможности использования различных типов химии – интеркалирующего красителя EvaGreen или TaqMan-проб;

Гибкость настроек позволяет масштабировать исследование и анализировать от 8 до 96 образцов за запуск;

Простой и удобный рабочий процесс;

Принцип капельной цифровой ПЦР с помощью технологии QX200 уменьшает вероятность погрешности эффективности амплификации и ингибирования ПЦР.