Система для цифровой капельной ПЦР — QX200 Droplet Digital PCR System

Система капельной цифровой ПЦР QX200 Droplet Digital PCR (ddPCR™) представляет собой третье поколение технологии ПЦР, которая позволяет определять абсолютное количество копий ДНК-мишени в образце. Чувствительность системы — одна копия ДНК на сто тысяч (на образец). Для проведения анализа не требуется использование стандартных калибровочных кривых. Система QX200 совместима как с детекцией, основанной на TaqMan-зондах, так и с интеркалирующим красителем EvaGreen. Цифровая ПЦР — это инновационная высокочувствительная технология, применяющаяся в исследованиях и диагностике наследственных заболеваний, рака, вирусной нагрузки, анализе качества подготовки библиотек для секвенирования нового поколения, высокопроизводительной селекции клонов в результате геномного редактирования и адаптации протокола по редактированию, а также для задач определения наличия ГМО в крайне низких концентрациях.
Решаемые задачи:
Количественная оценка биомаркеров рака. Мутации, ассоциированные с онкологией, часто не удается детектировать из-за их низкой концентрации по сравнению с фоновой ДНК дикого типа в том же образце. Высокая чувствительность системы QX200 позволяет детектировать и количественно оценивать мутации в концентрациях от 0,0001% — одна на сто тысяч, что в том числе позволяет детектирорвать маркерные мутации при жидкой биопсии;
Обнаружение и оценка возбудителей заболеваний. Точная количественная оценка вирусной нагрузки крайне важна для определения состояния заболевания, разработки, утверждения и оценки эффективности терапии. QX200 обладает чувствительностью, достаточной для обнаружения сверхмалых количеств вирусного генетического материала, в том числе и в сложных смесях;
Определение количества копий гена (CNV). Вариация числа копий гена — один из основных типов полиморфизмов в геноме человека. CNV ассоциируется с раком, неврологическими и аутоиммунными заболеваниями, а также с побочными эффектами при воздействии лекарственных средств. QX200 позволяет определить CNV с высокой точностью;
Валидация и количественная оценка библиотек NGS. Используя технологии цифровой ПЦР, можно качественно и количественно оценить созданную библиотеку для наиболее эффективного использования секвенаторов;
Анализ экспрессии генов. Капельная цифровая ПЦР позволяет количественно определить уровень экспрессии гена: возможна детекция даже минимального изменения экспрессии (10%), в том числе и при низких концентрациях;
Тестирование продуктов на наличие ГМО. С точностью до тысячных долей процента система QX200 позволяет оценить количество генетически модифицированных ингредиентов в продуктах питания, сырье и кормах.
Генератор капель QX200:
Исходный объем образца, мкл 20
Емкость, количество образцов/картридж 8 (QX200™ Droplet Digital™ PCR System) или 96 (QX200™ AutoDG™ Droplet Digital™ PCR System)
Количество капель на образец 20 000
Размеры, мм 280 х 360 х 130 (QX200™ Droplet Digital™ PCR System) 660 x 560 x 890 (QX200™ AutoDG™ Droplet Digital™ PCR System)
Ридер капель QX200:
Производительность, лунки/ч 32
Облучение образца — светодиоды
Каналы детектирования FAM (EvaGreen), HEX (VIC)
Размеры, мм 660 х 520 х 290
Линейный динамический диапазон, порядки 5
Точность ±10%
Количество капель на 96-луночный планшет, млн. более 1,5